En Mayo de 2006 se acuerda y establece el Comité de Coordinación del Programa de cooperación internacional MUNICIPIA, lo forman la AGENCIA ESPAÑOLA DE COOPERACION INTERNACIONAL PARA EL DESARROLLO (AECID), la FEDERACION ESPAÑOLA DE MUNICIPIOS Y PROVINCIAS (FEMP), el MINISTERIO DE ADMINISTRACIONES PUBLICAS y la CONFEDERACION DE FONDOS DE SOLIDARIDAD (CONFOCOS).

El 25 de enero de 2007 los promotores del Programa MUNICIPIA firman la Declaración Constitutiva del Programa con el objeto de impulsar, coordinar  y facilitar el esfuerzo de Cooperación al Desarrollo de los municipios españoles, con la voluntad de mejorar la eficacia del esfuerzo solidario municipal con las siguientes características:

• Es una iniciativa de coordinación de esfuerzos  de los distintos actores de Cooperación Española  para impulsar y fortalecer el mundo local y el municipalismo en todos los países donde trabaja de la Cooperación.
• Busca generar un espacio común de actuación, con objetivos compartidos, que permita a los actores públicos de la cooperación española, central y descentralizada, articular y vertebrar una acción  de cooperación municipal enfocada al mundo local de los países receptores de la ayuda.
• El programa MUNICIPIA asume las Declaraciones y recomendaciones de organismos internacionales y nacionales (Declaración de Paris, Agenda de ACCRA) que apelan a la necesidad de coordinarse y concertar esfuerzos entre los actores, prestando especial atención al criterio de coordinación que establecen los Planes Anuales de Cooperación Internacional, (PACI).
• El objeto del programa es la cooperación Municipal, busca mejorar las capacidades institucionales, políticas, sociales y económicas en el ámbito local. El Programa MUNICIPIA no entra en otros aspectos de apoyo al desarrollo  que puedan impulsar los municipios españoles.

Junto con la FEMP, los Fondos de Solidaridad y los Ayuntamientos se ha contado con la participación de organizaciones municipales de la cooperación como FUNDEMUCA o instituciones privadas como la UIM y MUSOL.